Подскажите, при проведение каких-либо документов выдается сообщение Ошибка СУБД, файл базы данных поврежден. и выкидывает с 1С.

Тестирование
конфигуратор - администрирование - тестирование и исправление - ... ну и дальше гоняй...

Есть утилита chdbfl.exe в каталоге bin - ей прогони

организуй нормально запись бэкапов

выгрузить/загрузить и т.д и т.п